A WWF tem como missão em Portugal a conservação da biodiversidade e a redução da pegada ecológica.
Projectos de conservação de maior importância para a biodiversidade:
- Habitats prioritários da Directiva Habitats
- Áreas de habitat crítico para espécies ameaçadas (como o Lince Ibérico, a Águia Imperial e o Saramugo).
A WWF intervém prioritariamente em áreas protegidas, Sítios de Rede Natura 2000 e Florestas de Alto Valor de Conservação.
